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泌尿中心提供高質量的器官移植服務，擁有陰式系列手術和腔鏡技術所需的先進醫療設備婦產科致力于女性健康，擁有系列手術和現代化診療手段所需的醫療設備，如腹腔鏡宮腔鏡等此外，醫院整體配備了尖端的醫療設備，如核磁共振成像系統CT掃描儀以及全自動檢驗設備，確保了精準的診斷同時，彩色超聲。

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北京大學航天中心醫院的醫療設備和服務設施相當齊全，特別關注以下幾個重點科室神經外科在治療重癥顱腦損傷方面具有出色的救治能力，采用高壓氧療法治療腦卒中效果顯著神經內科專注于神經系統疾病的診斷和治療，技術領先心胸外科心臟瓣膜置換手術技術精湛，同時提供導管介入治療服務心血管內科在心臟。

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醫院注重學科建設，逐步確立了以“兩心兩腦”等為重點學科，介入移植和微創為重點技術的專業特色神經外科心血管內科神經內科心胸外科泌尿疾病診療中心婦產科骨科是重點科室在顱腦損傷救治高壓氧治療腦卒中心臟瓣膜置換導管介入治療骨關節置換等方面的臨床研究和應用水平處于北京市。