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醫院注重學科建設和人才培養，以科技提高醫療質量，促進醫院可持續發展擁有國家重點學科2個內科學傳染病學外科學普外國家臨床重點專科22個檢驗科重癥醫學科心血管內科心臟大血管外科口腔頜面外科；各學科門類齊全，包括心血管內科消化內科普通內科包括呼吸血液腎病專業中山一院神經三科中山一院感染科麻醉手術科外一科包括肝膽乳腺甲狀腺外科專業胃腸外科心胸外科泌尿外科神經外科重癥。

重癥肌無力MG是一種由神經肌肉接頭處傳遞功能障礙所引起的自身免疫性疾病，臨床主要表現為部分或全身骨骼肌無力和易疲勞，活動后癥狀加重，經休息后癥狀減輕患病率為77～150100萬，年發病率為4～11100萬女性患病。

擁有衛生部突出貢獻中青年專家吉林省突出專業技術人才吉林省高級專家多人近百人在國家一二級學會國家核心雜志擔任委員編委醫院醫療特色明顯，科研實力強大設有50個臨床科室，7個醫技科室和1個中心研究室其中；南昌大學第一附屬醫院共有46個臨床醫技科室，擁有消化科神經外科心臟大血管外科重癥醫學科呼吸內科燒傷科疼痛科急診科等8個國家臨床重點專科，國家級診療中心1個以及省級臨床重點專科7個省醫學領先學科18個。

醫院現有國家中醫藥管理局中醫藥重點學科2個重點專科專病8個，省中醫藥重點學科13個重點專科專病6個國家中醫藥管理局中醫藥科研三級實驗室3個二級實驗室3個，國家級中藥制劑中心1個，國家級省級醫療中心10余個。